技術解説– category –
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技術解説
分析にSQLは必要なのか?【SQLで統計解析?】
分析という言葉を使うと広義になりすぎるので、統計解析という言葉を使います。 統計解析といっても平均や分散、割合等の記述統計から、推測統計まで様々あります。 近年はビッグデータも整備されつつあることから、SQLでビッグデータ解析というのが流行り... -
技術解説
データベース研究に役立つ医学知識の習得方法
リアルワールドデータを用いた研究を実施するには、医学知識が必要です。 サポートする立場(疫学・統計・データハンドリング)であっても、ある程度求められます。 医療従事者の方にとって当たり前のことであっても、医学に関する基礎知識がないと話につ... -
データベース
データベース環境の導入手順①【PostgreSQLのインストール】
データベース環境を導入について説明します。 世界中で最もよく使われているデータベースPostgreSQLを導入してみます。 【PostgreSQLのダウンロード】 はじめに、下記のサイトで皆さんのPCの環境に合ったPostgreSQLをダウンロードしてください。 Community... -
技術解説
医療系リアルワールドデータの前処理の特徴とその定義
リアルワールドデータは、電子カルテ内の画像やテキスト等の機械学習に頻用されるデータからゲノムデータまで様々な種類がある。 データ前処理は、解析対象とするデータの性質と解析手法によって実施目的や処理内容が大きく異なる。 例えば、機械学習目的... -
技術解説
医療系リアルワールドデータの利活用が進まないたった2つの理由【誰でも分かる二次利用の課題】
医療系リアルワールドデータの利活用、いわゆる二次利用は日本では進んでいないと言われています。 その理由については、細かくは様々あるのですが、主に2つに集約されます。 理由1: データ前処理の難易度が高い 理由2: プレイヤーの層が薄い これらについ... -
技術解説
リアルワールドデータのデータ前処理が難しいたった1つの理由【誰でも分かるように解説】
リアルワールドデータを用いた医学研究では、データ前処理に関して必ず認識しておかなければならないことがある。 従来までの臨床研究と比較すると、リアルワールドデータを用いた研究ではデータ前処理の負荷が極めて大きくなる。 その理由について、専門... -
技術解説
リアルワールドデータの特徴と今後の課題
リアルワールドデータという言葉が数年前から良く見聞きすると思います。 私はこの分野を専門として研究していますので、ある程度的を外さず議論できます。 【リアルワールドデータの定義】 リアルワールドデータの定義は、実ははっきりとしていません。 ... -
データベース
テーブルとビューの違い【データベース】
データベースにおける、テーブルとビューの違いについて説明します。 テーブルは皆さんご存じだと思いますので、ビューの定義から説明します。 「呼び出されたタイミングでその時点のデータに基づき正しい結果を返すこと」です。 いわゆる、テーブルのよう... -
技術解説
医療画像データセットの提供における課題
研究で医療画像データを所望する場合、大半のケースでは、患者の画像に関連する病名や処置と緊密に関連していると考えます。 (手当たり次第に画像データが欲しいというケースも存在するかもしれませんが、かなり稀だと思います。) ただし、すべての医療... -
技術解説
薬剤疫学分野におけるマスターデータの役割と標準化
薬剤疫学分野におけるマスターデータの役割について説明します。 今回は、用法マスタ(例:朝1回)を例に挙げて説明します。 はじめに、用法マスタを備えている機関は、下記の要件を満たしていると考えます。(前提として、用法マスタはなんらかのデータベ...